基于DNABERT編碼的啟動子預測模型

摘要： 啟動子是位于基因上游區(qū)域的特定DNA序列，通過識別和預測DNA序列中的啟動子，可以更好地理解基因調(diào)控的機制，促進生物學和醫(yī)學研究的進展。通過實驗的方法來預測啟動子既昂貴又費時，而通過計算方法進行啟動子預測同樣存在不足之處，如精度有待提升、序列編碼方式所包含的信息量不足等。該文提出了一種新的編碼方式，將預訓練模型DNABERT應用于啟動子預測的編碼，并測試了使用不同深度學習模型進... ... （共7頁）