上海市崇明區(qū)豬—土壤界面微生態(tài)與抗生素耐藥性相關(guān)性分析

摘要： 目的 探究養(yǎng)殖場(chǎng)內(nèi)育肥豬糞便與土壤的微生物組成和抗生素耐藥基因構(gòu)成，并挖掘之間的關(guān)聯(lián)。方法 選擇上海市崇明區(qū)5家豬養(yǎng)殖場(chǎng)，采集豬糞便和土壤樣本，使用Illumina NovaSeq 6000高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行全基因組鳥槍法測(cè)序。通過主坐標(biāo)分析、LEfSe分析、共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)分析和統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)，探究樣本微生物組成、多樣性特征和抗生素耐藥基因之間的關(guān)系。結(jié)果 豬糞便中的主要微生物包括擬桿菌... ... （共12頁）