基于密度聚類的染色質(zhì)拓?fù)湎嚓P(guān)結(jié)構(gòu)域識別方法

摘要： 高通量染色質(zhì)構(gòu)象捕獲（Hi-C）技術(shù)的快速發(fā)展為染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析提供了豐富的基因組位點(diǎn)間交互作用數(shù)據(jù)，但目前基于Hi-C數(shù)據(jù)的已有拓?fù)湎嚓P(guān)結(jié)構(gòu)域（TAD）識別方法存在準(zhǔn)確率低、參數(shù)敏感等問題。在此背景下，本文設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)了一種基于空間密度聚類的TAD識別方法。該方法首先對原始Hi-C數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理，得到歸一化后的Hi-C接觸矩陣數(shù)據(jù)；然后計(jì)算位點(diǎn)之間的距離矩陣，基于位點(diǎn)的核心距離和... ... （共8頁）