基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的慢性自發(fā)性蕁麻疹基因集富集及免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分析
中國(guó)免疫學(xué)雜志
頁(yè)數(shù): 6 2024-07-20
摘要: 目的:基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)(GEO)對(duì)慢性自發(fā)性蕁麻疹(CSU)表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)篩選差異表達(dá)基因并進(jìn)行基因集富集分析(GSEA)和免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分析,深入了解CSU的發(fā)病機(jī)制。方法:從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取GSE72541芯片數(shù)據(jù),利用R軟件獲取差異表達(dá)基因并構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò);利用GSEA軟件進(jìn)行基因本體論(GO)和京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)富集分析;利用ssG... (共6頁(yè))